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氣相色譜儀襯管或者進樣口被污染時，常常會造成樣品色譜特征的變化，如導致峰不對稱、譜圖變形等。為保證儀器的分離效果以及分析結果的精密度、準確性，需要經常保養襯管和進樣管。
為降低因襯管和進樣口被污染給測定結果帶來的影響，應經常對襯管和進樣口內部、進樣口過渡接頭等進行檢查、清洗，必要時要更換襯管。對于襯管和進樣口的保養，一般分為日常保養和定期保養。
1、襯管的保養
a、襯管的日常保養：清洗襯管，是常用的保養方法，適用于襯管內壁被污染或有進樣隔墊碎屑。首先，從儀器中小心取出襯管，用鑷子或其他小工具小心移去襯管內的殘留雜屑和裝填物如玻璃毛，移取過程不要劃傷襯管表面。先將襯管上端的石墨壓環(或硅橡膠環)卸下，這上面易附著溶劑，會導致鬼峰。將襯管泡在有機溶劑(如丙酮)里，然后，用蘸有溶劑(如丙酮等)的紗布擦洗襯管內壁。如果襯管內壁上的嚴重污垢部分擦不掉，可將襯管浸于有機溶劑(如丙酮等)中放置數小時，直到能用蘸溶劑的紗布擦凈內壁。zui后，烘干(或吹干)襯管，裝入新的填充物，裝好襯管。
b、襯管的定期保養：襯管內的裝填物填裝不當，或裝填物、襯管內壁有活性點，可能導致分析樣品被吸附或分解，直接導致實驗結果重現性差。如襯管或裝填的石英棉活性過高時，分析有些農藥樣品的色譜峰會重現性差現象，結果也會有很大的偏差。
一般分析極性樣品時，要及時更換或硅烷化襯管和裝填的玻璃棉。襯管和玻璃棉的DMCS(二甲基氯硅烷化)處理，可如下操作：
首先，將襯管、石英棉用丙酮等有機溶劑清洗，晾干后在5％DMCS-正己烷中浸泡一夜。然后，取出浸泡后的襯管、石英棉，立即用甲醇清洗2～3次，再在甲醇中浸1h左右。浸泡后取出，晾干后，裝好襯管。
2、進樣口的保養
a、進樣口的定期保養：更換隔墊；清洗或更換進樣針；進行泄漏測試和維修；清洗或更換襯管／內插件；更換O形環；清洗或更換分流平板和金屬墊片(SSI)等。
b、進樣口的日常保養：首先要確保儀器各部件處于正常工作狀態。檢查氣源(建議低于2MPa時更換氣瓶)，檢查是否漏氣，進樣口溫度不要超過隔墊的zui高使用溫度，在進樣前要注意樣品的凈化處理，使用質量好的進樣器，減少隔墊碎屑的干擾。
